As atividades de Auditoria visam à revisão de demonstrações financeiras, sistema financeiro, registros, transações e operações de uma entidade ou de um projeto, com a finalidade de assegurar a fidelidade dos registros, proporcionando credibilidade às demonstrações financeiras e outros relatórios da administração, podendo propor critérios e recomendações de melhoria.
Por sua vez, as atividades de Controladoria têm como objetivo avaliar os critérios de controles administrativos, monitorar o cumprimento das determinações legais e normas administrativas, realizar verificações nos processos e operações para avaliar a integridade e segurança e verificar a regularidade das atividades desenvolvidas pelos órgãos e entidades da Administração.