No exercício da macrofunção Controladoria, exercida por meio da Coordenadoria Central de Controle, a CGM busca assessorar e apoiar os agentes públicos por meio de ações de orientação, capacitação, acompanhamento e avaliação das atividades, com o objetivo de aprimorar os controles, otimizar as rotinas e melhorar a gestão dos recursos.
Por meio de ações de monitoramento dos recursos públicos, a atuação do controle interno abrange a verificação da aplicação dos recursos repassados às entidades privadas sem fins lucrativos, por meio de termo de colaboração, fomento, contrato de gestão e outros instrumentos congêneres, das prestações de contas do suprimento de fundos (adiantamentos confiados a servidores públicos), da regularidade das autorizações e concessões de viagens e diárias, bem como o acompanhamento do cumprimento de normativos e determinações emanados pelos órgãos de controle externo.
Por sua vez, a Coordenadoria Central de Acompanhamento dos Núcleos de Controle Interno, por meio das Unidades de Controle Interno Setoriais, tem o mister de acompanhar os controles internos das áreas de atuação da gestão governamental no âmbito dos órgãos da Prefeitura Municipal do Salvador em que estiverem alocados, com vistas à mitigação dos pontos de fragilidade e suscetibilidade à corrupção e redução de falhas involuntárias.
